The taxonomy and phylogeny of the genera Cystoderma and Cystodermella (Agaricales, Fungi)

Date

2012-01-26

Journal Title

Journal ISSN

Volume Title

Publisher

Abstract

Doktoritöös käsitletakse lehikseente perekondade Cystoderma (pisisirmik) ja Cystodermella liikide biosüstemaatikat ja evolutsiooni. Töös kasutati morfoloogilisi ja molekulaarseid tunnuseid ning fülogeneetika ja elurikkuse informaatika meetodeid. Kinnitust leidis hüpotees, et erinevate seeneliikide ja isegi nende kahe perekonna eristamine ei ole ainult morfoloogilisi ja anatoomilisi tunnuseid kasutades võimalik. Doktoritöös kasutati nende eristamiseks edukalt rDNA ITS ja LSU geenijärjestusi. Cystoderma ja Cystodermella liikide molekulaarseks määramiseks loodi rDNA ITS järjestuste baasil DNA triipkoodid. Viimased võimaldavad rahvusvahelise seente molekulaarse määraja UNITE (http://unite.ut.ee) abil määrata neid liike kõigist bioloogilistest proovidest, kus vastava liigi DNA esineda võib. Siia rühma kuuluvate seente eluviis on siiani täpselt teadmata, kuid DNA triipkoodide olemasolu võimaldab nende liikide seeneniidistiku leidumist määrata nii teistest organismidest kui ka erinevatest substraatidest, näiteks metsavarisest ja mullast. Esmakordselt on nüüd võimalik testida hüpoteese nende seente võimalikest suhetest sammaldega ja/või osalemist kõdulagundamises. ITS geenijärjestustel põhineva analüüsi tulemuste põhjal arvati seeneperekond Phaeolepiota (kuldmampel) perekonda Cystoderma. Doktoritöös kirjeldati kaks teadusele uut liiki Ecuadorist – Cystoderma andinum ja Cystodermella papallactae ning koostati perekondade Cystoderma ja Cystodermella kõigi teadaolevate liikide kriitiline nimestik. Eestist leiti esmakordselt liigi Cystoderma japonicum eksemplar, mis on ilmselt esimene leid väljaspoolt Jaapanit, kust selle liigi tüüpeksemplar on leitud ja kirjeldatud.

Description

Väitekirja elektrooniline versioon ei sisalda publikatsioone.

Keywords

lehikseened, pisisirmikud, taksonoomia, fülogenees, Agaricales, Cystoderma, taxonomy, phylogeny

Citation