Ülevaade kromatiini immuunosadestamise meetodist ja restriktsiooniensüümide testimine kromatiini fragmenteerimiseks
Date
2016
Authors
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Tartu Ülikool
Abstract
Käesolev töö annab põhjaliku etapiviisilise ülevaate DNA ja valkude interaktsioonide
uurimiseks kasutatavast kromatiini immuunosadestamise (ChIP) meetodist ning DNA ja
valkude vaheliste interaktsioonide uurimise olulisusest. Töös on kirjeldatud erinevaid
võimalusi identifitseerimaks ChIP-il immuunosadestatud DNA-d ja toodud välja uudsed
edasiarendused konventsionaalsest ChIP-st, kasutades algmaterjalina väikest hulka rakke. Eksperimentaalses osas on testitud veel väljaarendamisel oleva NRA-ChIPmentation meetodi kromatiini fragmenteerimise etapil potentsiaalselt kasutatavate restriktaaside efektiivsust kromatiini fragmenteerimisel.
Description
Keywords
histoonid, transkriptsioonifaktorid, kromatiini immuunosadestamine, ChIP, NRAChIPmentation