Pseudomonas putida füsioloogilise seisundi ja regulaatori Fis mõju GacS/GacA süsteemi alumiste geenide transkriptsioonile
Date
2016
Authors
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Tartu Ülikool
Abstract
P. putida on mullabakter, kes on võimeline koloniseerima taimejuuri ning moodustama biofilmi.
Biofilm on taimele kasulik, kuna bakter kaitseb taime fütopatogeenide eest, taim eritab
vastukaaluks keskkonda toitaineid. Biofilmi teke on kompleksne protsess, seetõttu on olulised
mitmed signaalrajad ja globaalsed regulaatorid, näiteks GacS/GacA süsteem ning Fis. Käesolevas
töös uuriti, kas Fis reguleerib GacS/GacA süsteemi kuuluvate rsmA ja sRNA-de transkriptsiooni
ning kas nende geenide transkriptsioon sõltub bakteri füsioloogilisest seisundist. Katsetest
järeldus, et Fis mõjutab sRNA-de transkriptsiooni negatiivselt, rsmA-de transkriptsiooni
positiivselt ning geeniregulatsioon sõltub bakteri füsioloogilisest seisundist. Seega Fis reguleerib
GacS/GacA süsteemi geene ning võib seeläbi mõjutada ka biofilmi tekkeks vajalike geenide
transkriptsiooni
Description
Keywords
Pseudomonas putida, Fis, GacS/GacA, rsmA, sRNA-d