Spetsiifiliste ​k ​ -meeride leidmine inimesel toiduallergiat põhjustavate loomaliikide määramiseks

Jõesaar, Andrea

Spetsiifiliste k -meeride leidmine inimesel toiduallergiat põhjustavate loomaliikide määramiseks

dc.contributor.advisor	Andreson, Reidar, juhendaja
dc.contributor.author	Jõesaar, Andrea
dc.contributor.other	Tartu Ülikool. Loodus- ja täppisteaduste valdkond	et
dc.contributor.other	Tartu Ülikool. Molekulaar- ja rakubioloogia instituut	et
dc.date.accessioned	2020-06-18T09:00:14Z
dc.date.available	2020-06-18T09:00:14Z
dc.date.issued	2020
dc.description.abstract	Tänapäeval on ligi 2% täiskasvanutest toiduallergiad ja ka ristsaastumisel toitu sattunud allergeen osutuda mõnele allergikule ohtlikuks. Allergeenide tuvastamiseks proovist saab kasutada teise põlvkonna sekveneerimisel põhinevaid k -meere ehk k pikkuseid DNA lõike kasutavad meetodeid, mis pakuvad suurt tundlikkust ning täpsust. Tänu oma haploidsele pärandumisele, rohkusele keskkonnaproovis ja vähesele rekombinatsioonile on liikide eristamiseks tüüpiliselt kasutusel mitokondriaalne DNA. Käesoleva töö põhieesmärk oli töötada välja metoodika spetsiifiliste k -meeride leidmiseks sihtmärgiks olevate loomaliikide mitokondritest. Loodud meetod, mis põhineb filtreerimisel kasutades programmi nblast , leiab ühele sihtmärgile k -meeride komplekti keskmiselt 34 minutiga. Leiti, et saadud k -meeride komplektid annavad üldiselt tugeva signaali, kui neid testida sihtmärgi täisgenoomil toorlugemitel	et
dc.identifier.uri	http://hdl.handle.net/10062/68041
dc.publisher	Tartu Ülikool	et
dc.rights	openAccess	et
dc.rights	Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International	*
dc.rights.uri	http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/	*
dc.subject	k-meerid	et
dc.subject	toiduallergia	et
dc.subject	NGS	et
dc.subject	GenomeTester4	et
dc.subject.other	bakalaureusetööd	et
dc.title	Spetsiifiliste k -meeride leidmine inimesel toiduallergiat põhjustavate loomaliikide määramiseks	et
dc.type	Thesis	et