Translatsiooni täpsus tRNA antikoodonlingu Ψ32 ja Ψ38-40 puudumisel

Abstract

Pseudouridiinid (Ψ) on laialt levinud posttranskriptsioonilised modifikatsioonid RNA-s, mis esinevad kõigis eludomeenides. Kuigi põhjalikult uuritud, puudub seletus pseudouridiinide konserveerumisel ning levikul. Ψ-süntaasid TruA ja RluA isomeriseerivad uridiine bakterite tRNA antikoodonlingus. Laboritingimustes pole kumbki ensüüm bakterile eluks vajalik, aga varasemalt on näidatud seos tRNA antikoodonlingu modifikatsioonide ning translatsiooni täpsuse vahel. Käesolevas töös on võrreldud translatsiooni täpsust bakterites Pseudomonas putida, Pseudomonas aeruginosa ja Escherichia coli. Samuti on näidatud, et TruA, aga mitte RluA, puudumine mõjutab translatsiooni täpsust neis bakterites