Pseudomonas putida transporteri geeni lapE transkriptsiooni sõltuvus globaalsetest regulaatoritest

Abstract

Käesolevas töös uuritakse Psedomonas putida geeni lapE transkriptsiooni sõltuvust järgmistest globaalsetest regulaatoritest: Fis, PhoB ja RpoS. LapE moodustab LapB ja LapCga kompleksi, mis transpordib kleepvalku LapA-d raku pinnale, võimaldades bakteril kinnituda taime juurtele ning moodustada biofilmi. P. putida eelistab elada taime juurtel, sest taim eritab oma juurte kaudu mulda mitmesuguseid bakteritele vajalikke toitaineid. Samal ajal soodustab P. putida taime kasvu ning kaitseb seda patogeenide eest. Biofilmi moodustamine on P. putida’le oluline protsess ning seepärast reguleeritakse seda mitmeid radu pidi. Eelnevalt on põhjalikult uuritud P. putida biofilmi moodustamise regulatsiooni LapA posttranslatsioonilise regulatsiooni kaudu. Biofilmi regulatsioonist transportervalkude kaudu on aga vähe teada. Käesolevas töös leiab kinnitust, et lapE geeni ees on vähemalt kaks promootorit, mis pole RpoS-st sõltuvad. Geeni lapE transkriptsioon ei sõltu PhoB-st LB söötmes, kuid Fis reguleerib transkriptsiooni nii positiivselt kui negatiivselt.