Kromosoomipõhise k-meer sageduse ja tsentromeeri pikkuse vahelise korrelatsiooni leidmine

Abstract

Tsentromeerid on inimese genoomi kriitilised piirkonnad, millel on oluline roll kromosoomide stabiilsuses ja jagunemises. Nende piirkondade uurimist on pikalt takistanud sekveneerimistehnoloogiate piirangud, kuid uued pika ja ülipika lugemiga tehnoloogiad on avanud võimaluse nende struktuuri täpsemaks analüüsiks. Üheks kasulikuks meetodiks on k-meer põhine sagedusanalüüs, mis võimaldab hinnata korduspiirkondade ulatust ning varieeruvust. Käesoleva töö eesmärk on uurida, kas inimese kromosoomide tsentromeeride pikkuse ja k-meeride sageduse vahel esineb seos. K-meer põhine analüüs võimaldab hinnata korduspiirkondade struktuuri ja potentsiaalselt ka nende pikkust. Töö tulemused aitavad hinnata selle meetodi sobivust tsentromeeri omaduste kaudseks määramiseks.