Põistang-paelussi (Echinococcus granulosus sensu stricto) globaalne geneetiline mitmekesisus ja fülogeograafia

Abstract

Echinococcus granulosus sensu stricto (s.s.) ehk põistang-paeluss on väike parasiit, kes põhjustab zoonootilist haigust nimega tsüstiline ehhinokokoos. Parasiidi levik on globaalne ja ta on ohtlik nii loomadele kui ka inimestele. ÜRO Toidu- ja Põllumajandusorganisatsioon on maailmas toiduga levivate haiguste seas kategoriseerinud põistangpaelussi tähtsuselt teisele kohale, mis näitab, kui suure rahvatervise probleemiga tegemist on. Antud töö eesmärgiks on kaardistada Pakistanist, Indiast ja Ukrainast saadud proovide genotüübid ja analüüsida nende geneetilist mitmekesisust mtDNA järjestuste põhjal. Samuti kaasates teiste poolt varem analüüsitud homoloogilisi mtDNA järjestusi, selgitada välja analüüsitud Pakistan, India ja Ukraina proovide evolutsioonilised seosed nendega ning globaalse fülogeograafia eripärad, sh. peamised migratsiooni suunad. Töös analüüsiti Pakistanist, Indiast ja Ukrainast pärinevaid proove. Kokku sekveneeriti 86 uut mtDNA järjestust pea kogu mitogenoomi ulatuses (11549 aluspaari). Andmeanalüüsiks täiendati valimit 335 eelnevalt sekveneeritud ja eri maailma piirkondadest pärit E. granulosus s.s. homoloogilise mtDNA järjestuse võrra, neist 280 kuulusid genotüüpi G1 ja 55 genotüüpi G3. Täiendatud andmekoguga teostati fülogeneetiline ja fülogeograafiline analüüs. Analüüside tulemused näitasid, et nii G1 kui ka G3 genotüüpide geneetiline mitmekesisus on väga kõrge. Samas G1 on fülogeograafiliselt nõrgalt struktureeritud, st. samast regioonist pärit proovid olid sageli geneetiliselt üksteisest kauged. Eeldatavaks põhjuseks on rahvusvaheline loomakaubandus. Seevastu G3 on fülogeograafiliselt hästi struktureeritud ja geograafiliselt lähedased isolaadid olid enamasti ka geneetiliselt lähedased. Seega kui G1 on loomakaubanduse tõttu geograafiliselt segunenud, siis G3 fülogeograafiline jaotus on pigem loodusliku leviku tulemus.