Puukborrelioos: geneetilised riskitegurid ja nakkusega seotud terviseriskid TÜ Eesti geenivaramu andmete põhjal

Abstract

Bakalaureusetöö eesmärk on uurida puukborrelioosiga kaasnevaid terviseriske ning nakkusest tulenevaid haigestumisriske. Soovitakse leida põhjapanevaid tulemusi, mida Eesti meditsiinisüsteem saaks kasutada raskemate haiguste ennetuseks. Töös kasutatakse peamiselt hii-ruut testi ning logistilist regressiooni seose tugevuse hindamiseks. Lisaks on rakendatud eraldi PheWASi, mille järel on kasutatud Mendeli randomiseerimist põhjusliku seose tugevuse jaoks. Esmalt antakse töös ülevaade puukborrelioosist ning sellega tulenevatest terviseprobleemidest. Seejärel kirjeldatakse seoseuuringute tüüpe GWAS ja PheWAS, miks neid kasutatakse ning nende erinevusi. Lõpuks tehakse kokkuvõte töös kasutatavatest meetoditest, näiteks hii-ruut test, logistiline regressioon, mitmese testimise probleem ning Mendeli randomiseerimine. Nende meetodite põhjal teostatakse analüüs puukborrelioosi ning puukborrelioosi soodustavale geneetilise riskiteguri mõjule teistele haigustele, kasutades Tartu Ülikooli Eesti geenivaramu andmeid.