Vahetatud domeenidega alfaviirustes tekkinud kompensatoorsete mutatsioonide mõju uurimine
Date
2016
Authors
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Tartu Ülikool
Abstract
Eelnevalt oli leitud 10 kompensatoorset mutatsiooni, mis tekkisid vahetatud domeenidega alfaviiruste adapteerimisel. Need mutatsioonid viidi ükshaaval esialgsesse viirusesse, et uurida, kuidas leitud asendused mõjutavad viiruse elujõulisust ja omadusi. Võrreldi viiruste infektsioonilisust, nakkuse käiku, virionide moodustamise võimet, replikatsiooniefektiivsust ja kasvudünaamikat. Identifitseeriti 5 mutatsiooni, mis taastasid algse nõrga viiruse infektsioonilisuse, olles kasulikud erinevates nakkustsükli etappides. Leiti mutatsioonialdis piirkond, mis võis ühe viiruse kontekstis oluliselt tõsta viiruse edukust. Saadud tulemuste ja avaldatud kirjanduse põhjal arutleti kompensatoorsete mutatsioonide võimaliku rolli ja tähtsuse üle, pakkudes välja oletusi selle kohta, kuidas asendused viiruse elutsükli eri samme mõjutavad.
Description
Keywords
alfaviirused, mittestruktuursed valgud, domeenide vahetamine, kompensatoorsed mutatsioonid