ppGpp Pseudomonas putida faagivastases kaitses

Abstract

Bakterid peavad elu jooksul toime tulema väga erinevate stressitingimustega, teiste seas bakteriofaagide (faagide) rünnakutega. Paljude stressitingimuste üleelamiseks on bakteritel vajalik poomisvastus, mille vallandab alarmoonmolekul ppGpp. Lisaks teistele stressiolukordadele on ppGpp vahendatud poomisvastuse olulisust täheldatud ka bakteri kaitses faagirünnakute vastu, kuid selle täpsed mehhanismid pole veel selged. Samuti pole seda Pseudomonas putida puhul varasemalt uuritud, kuna varasemalt on isoleeritud vaid üksikuid seda bakerit nakatavaid faage. Käesoleva töö eesmärk oli faagide ppGpp-sõltuvust uurides välja selgitada ppGpp ja ühtlasi ka poomisvastuse mõju P. putida faagitaluvusele. Tulemused näitavad, et ppGpp-l on faagiresistentsuses oluline roll, suurendades P. putida faagitaluvust 74% uuritud faagide korral ning osade faagide puhul kuni ligi 100 korda võrreldes ppGpp deletsioontüvega. Veel näitavad tulemused, et ppGpp-sõltuvuse tugevus on varieeruv ning erineb uuritud faagidel tugevalt. Samuti ilmnes poomisvastuse kaitse erinev tugevus tahkel ja vedelas söötmes.