ppGpp Pseudomonas putida faagivastases kaitses
Date
2023
Authors
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Tartu Ülikool
Abstract
Bakterid peavad elu jooksul toime tulema väga erinevate stressitingimustega, teiste seas
bakteriofaagide (faagide) rünnakutega. Paljude stressitingimuste üleelamiseks on bakteritel
vajalik poomisvastus, mille vallandab alarmoonmolekul ppGpp. Lisaks teistele
stressiolukordadele on ppGpp vahendatud poomisvastuse olulisust täheldatud ka bakteri kaitses
faagirünnakute vastu, kuid selle täpsed mehhanismid pole veel selged. Samuti pole seda
Pseudomonas putida puhul varasemalt uuritud, kuna varasemalt on isoleeritud vaid üksikuid
seda bakerit nakatavaid faage. Käesoleva töö eesmärk oli faagide ppGpp-sõltuvust uurides välja
selgitada ppGpp ja ühtlasi ka poomisvastuse mõju P. putida faagitaluvusele. Tulemused
näitavad, et ppGpp-l on faagiresistentsuses oluline roll, suurendades P. putida faagitaluvust 74%
uuritud faagide korral ning osade faagide puhul kuni ligi 100 korda võrreldes ppGpp
deletsioontüvega. Veel näitavad tulemused, et ppGpp-sõltuvuse tugevus on varieeruv ning
erineb uuritud faagidel tugevalt. Samuti ilmnes poomisvastuse kaitse erinev tugevus tahkel ja
vedelas söötmes.
Description
Keywords
Pseudomonas putida, faagiresistentsus, ppGpp, poomisvastus