Ülegenoomsete geen-geen koosmõjude hindamise meetodi valideerimine
Date
2014-06-16
Authors
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Tartu Ülikool
Abstract
Käesoleva bakalaureusetöö eesmärgiks on uue meetodi valideerimine geen-geen koosmõjude uurimiseks ülegenoomsetes assotsiatsiooniuuringutes. Esmalt tuuakse ülevaade ülegenoomsetest uuringutest ja seal kasutatavast statistilisest metoodikast ning bioloogilise ja statistilise koosmõju mõistetest. Järgnevalt kirjeldatakse kahte meetodit, mille abil koosmõjusid määrata, ning rakendatakse neid simuleeritud andmetel ja Tartu Ülikooli Eesti Geenivaramu andmetel. Esimene meetod reaalsetel andmetel ei tööta, kuid teine meetod annab rahuldavaid tulemusi. Teist meetodit plaanitakse rakendada uues geen-geen koosmõjude määramise programmis.
Description
Keywords
geneetilised assotsiatsiooniuuringud, interaktsioonid, statistilised meetodid, valideerimine