Kromosomaalsete toksiin-antitoksiin süsteemide hind bakterile Pseudomonas putida

Abstract

Arvatakse, et kromosomaalsed toksiin-antitoksiin (TA) süsteemid on bakteritele olulised erinevate keskkonna-stressidega toimetulekuks. Aktiivseid valke kodeerivate genoomsete TA süsteemide rohkus viitab, et kromosomaalsed TA süsteemid peaksid bakterile kasulikud olema, samas pole tihti operoni deleteerimisel bakterile mingit negatiivset mõju täheldatud. Käesoleva uurimistöö eesmärgiks oli testida hüpoteesi, et kromosomaalsed TA süsteemid on bakterile P. putida kulukad. Samuti selgitasin mõningate P. putida toksiinide toksilisuse määra konkurentsikatses. Tulemused näitasid: (1) toksiin-antitoksiin süsteemid ei ole bakterile otseselt vajalikud, kuid pole talle ka koormaks. Kuna toksiin-antitoksiin süsteemid ei ole bakterile kulukad võib järeldada, et ka valikusurve nende süsteemide genoomist eemaldamiseks on nõrk; (2) P. putida toksiinid MazF, RelE ja HicA-1 on inaktiivsed; (3) P. putida toksiin MqsR on aktiivne.