Ülevaade kromatiini immuunosadestamise meetodist ja restriktsiooniensüümide testimine kromatiini fragmenteerimiseks

Abstract

Käesolev töö annab põhjaliku etapiviisilise ülevaate DNA ja valkude interaktsioonide uurimiseks kasutatavast kromatiini immuunosadestamise (ChIP) meetodist ning DNA ja valkude vaheliste interaktsioonide uurimise olulisusest. Töös on kirjeldatud erinevaid võimalusi identifitseerimaks ChIP-il immuunosadestatud DNA-d ja toodud välja uudsed edasiarendused konventsionaalsest ChIP-st, kasutades algmaterjalina väikest hulka rakke. Eksperimentaalses osas on testitud veel väljaarendamisel oleva NRA-ChIPmentation meetodi kromatiini fragmenteerimise etapil potentsiaalselt kasutatavate restriktaaside efektiivsust kromatiini fragmenteerimisel.