Rekombinatiivse helikaasi Irc3 C- ja N-terminaalsete domeenide funktsioonide analüüs

Abstract

Mitokondriaalse DNA terviklikkus on vajalik aeroobseks hingamiseks. S. cerevisiae tuuma genoomilt kodeeritavad valgud on vajalikud mitokondriaalse DNA metabolismiks, nende hulgas ka helikaasid. DExH/D-box perekonna helikaas Irc3 on otseselt seotud S. cerevisiae mitokondriaalse DNA metabolismiga. Helikaaside lisadomeenid varieeruvad funktsioonilt ning struktuurilt. Antud töö eesmärk oli teostada Irc3 valgu N- ja Cterminaalsete domeenide biokeemiline analüüs. Tööst selgus, et Irc3 valgu N-terminaalne domeen on DNA poolt stimuleeritud ATP hüdrolüüsimise aktiivsusega, kuid C-terminaalne domeen mitte. C-terminaalne domeen seondus Holliday ühendust meenutava substraadiga sarnase afiinsusega kui metsiktüüpi Irc3 valk, kuid N-terminaalne domeen antud katsesüsteemis DNA-d märgatavalt ei sidunud.