The autoimmune regulator protein participates in loop formation between epidermal differentiation complex gene family members

Abstract

Käesolev uurimus keskendub autoimmuunregulaator (AIRE) valgu funktsioneerimismehhanismi väljaselgitamisele. AIRE valk mängib olulist rolli T-rakkude negatiivses selektsioonis, mille käigus suunatakse tüümuses oma organismi valke ära tundvad ehk autoreaktiivsed T-rakud apoptoosi. On teada, et AIRE on transkriptsiooniregulaator, mis on võimeline aktiveerima tuhandeid erinevaid geene tüümuses, mis muidu on ekspresseerunud vaid kindlates kudedes. AIRE mutatsioonide puhul on nende koespetsiifiliste geenide ekspressioon tüümuses alla surutud ning võimaldatakse autoreaktiivsete T-rakkude väljapääsemist perifeersetesse kudedesse, kus nad põhjustavad autoimmuunreaktsioone. Täpne mehhanism, kuidas AIRE tagab tolerantsuse, on siiamaani teadmata. Arvestades AIRE poolt aktiveerivate geenide suurt arvu, eeldatakse, et AIRE aktiveerib geene epigeneetiliste mehhanismide kaasahaaramise abil. Mina rakendasin kromosomaalse konformatsiooni vangistamise (3C) meetodikat, et uurida, kas AIRE mõju geeni aktivatsioonile võib olla vahendatud lingude moodustamise kaudu aktiveerivate geenide vahel.