Korduste arvu hindamine tsentromeeris
Date
2023
Authors
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Abstract
Inimese genoomis on piirkondi, mis sisaldavad korduseid. Üheks palju korduseid sisaldavaks piirkonnaks on tsentromeer - koht, kust saab alguse DNA replikatsioon rakkude jagunemise korral. Bakalaureusetöös keskendutakse tsentromeeri piirkonnas esinevate korduste arvule. Töös uuritakse kolme (erinevatel kromosoomidel paiknevat) korduvat motiivi ja kirjeldatakse nende kolme korduva motiivi korduste arvu jaotust Eestis. Tutvustatakse statistilisi meetodeid korduste arvu hindamiseks; segujaotusel põhinevaid mudeleid korduste arvu jaotuse kirjeldamiseks ja uuritakse kui palju korduste arvu variante võiks Eestis esineda.
Description
Keywords
k-meer, lugem, kordused, järgmise põlvkonna sekveneerimine, suurima tõepära hinnang, tõepärasuhte test, segujaotus, k-mer, read, repeats, next generation sequencing, maximum likelihood method, likelihood ratio test, mixture distribution