RNA modifikatsiooni m6Am roll inimese keratinotsüütide rakulise vastuse reguleerimisel

Abstract

RNA modifikatsioonid on keemilised funktsionaalsed rühmad, mis esinevad RNA lämmastikalusel, riboosil või fosfaatjäägil. Modifikatsioone leidub näiteks: informatsiooni RNA-s (mRNA), transport-RNA-s (tRNA), ribosomaalses RNA-s (rRNA) ning paljudel teistel RNA tüüpidel. Üks modifikatsioonidest on mRNA-l esinev N6,2′-O-dimetüüladenosiin (m6Am), kus metüleeritakse riboosi suhkur teises positsioonis ja lämmastikalus kuuendas positsioonis. Imetajatel katalüüsib m6Am modifikatsiooni vaid üks ensüüm: fosforüleeritud C terminaalse domääniga interakteeruv faktor 1 (PCIF1). Bakalaureusetöö eesmärk on vaigistada (knockdown (KD)) PCIF1 normaalsetes inimese epidermaalsetes keratinotsüütides (NHEK), ning teha kindlaks kuidas m6Am puudumine mõjutab valitud efekti rakulise vastusega seotud geenide avaldumist. Töö tulemusena leiti, et PCIF1 KD põhjustab Janus kinaaside ja signaali edasikandvate ja transkriptsiooni aktiveerivate valkudega (JAK-STAT) signaaliraja geenide ülesreguleerimist nii mRNA kui ka valgu tasemel ning toodi välja võimalik seos psoriaasiga ja atoopilise dermatiidiga.