Pseudomonas putida füsioloogilise seisundi ja regulaatori Fis mõju GacS/GacA süsteemi alumiste geenide transkriptsioonile

Abstract

P. putida on mullabakter, kes on võimeline koloniseerima taimejuuri ning moodustama biofilmi. Biofilm on taimele kasulik, kuna bakter kaitseb taime fütopatogeenide eest, taim eritab vastukaaluks keskkonda toitaineid. Biofilmi teke on kompleksne protsess, seetõttu on olulised mitmed signaalrajad ja globaalsed regulaatorid, näiteks GacS/GacA süsteem ning Fis. Käesolevas töös uuriti, kas Fis reguleerib GacS/GacA süsteemi kuuluvate rsmA ja sRNA-de transkriptsiooni ning kas nende geenide transkriptsioon sõltub bakteri füsioloogilisest seisundist. Katsetest järeldus, et Fis mõjutab sRNA-de transkriptsiooni negatiivselt, rsmA-de transkriptsiooni positiivselt ning geeniregulatsioon sõltub bakteri füsioloogilisest seisundist. Seega Fis reguleerib GacS/GacA süsteemi geene ning võib seeläbi mõjutada ka biofilmi tekkeks vajalike geenide transkriptsiooni