Pseudouridiini süntaasi TruA osalus mullabakter Pseudomonas putida KT2440 mutatsiooniprotsessides

Abstract

Varasemalt on leitud seos tRNA antikoodoni läheduses paiknevate modifikatsioonide –pseudouridiinide ja mutatsioonisageduse vahel mullabakteris Pseudomonas putida. Näidati, et pseudouridiini süntaasi TruA kodeeriva truA aktiivsuse puudumisel on P. putida kasvavate rakkude mutatsioonide tekkesagedus tõusnud, kuid statsionaarses kasvufaasis olevates bakterites truA geeni puudumise mõju mutantide tekkesagedusele pole veel teada. Käesolevas töös uurisin TruA puudumise mõju statsionaarse faasi mutatsioonisagedusele, kasutades selleks laktoosi kasutuselevõtul põhinevat testsüsteemi, mis võimaldab tuvastada β galaktosidaasi geenis lacZ tekkivaid mutatsioone, mis võimaldavad spetsiaalsetel Lac testertüvedel hakata kasutama laktoosi süsinikallikana. Töö tulemusena selgus, et kuigi truA puudumine ei tõstnud P. putida tüvedes statsionaarse faasi mutageneesi, täheldati võimalikku osalust raaminihkemutatsioonide tekkes.