Hiiremudeli kasutamine inimese soolestiku mikrobioomi uurimiseks
Date
2023
Authors
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Tartu Ülikool
Abstract
Inimese mikrobioomi analüüsimiseks kasutatakse tihti loommudeleid, millest levinuim on hiir.
Üheks uurimismeetodiks on fekaalne mikrobioota siirdamine, mille teel kantakse inimese
mikroobikooslus üle katselooma. Sellise meetodi kasutamine on mikrobioomi uuringutes
levinud, kuid vähe on analüüsitud, kui informatiivne on katseloomana kasutatav hiir inimese
mikroobikoosluste uurimiseks. Bakalaureusetöö raames analüüsiti Eesti Mikrobioomi projekti
(EstMB) doonorite väljaheiteproove ja fekaalse transplantatsiooni läbinud hiirte mikrobioomi
enne ja pärast siirdamist. Analüüsi käigus leiti uurimisgruppide vahel märkimisväärseid
erinevusi nii bakteriperekondade kui ka mikroobikoosluse mitmekesisuse tasandil. Täpsemate
järelduste tegemiseks tuleks läbi viia metagenoomne analüüs, mis võimaldaks kooslusest
tuvastada lisaks bakteritüvedele viiruseid ja eukarüoote ning muid mikrobioomi komponente.
Description
Keywords
mikrobioom, loommudelid, 16S rRNA geeni sekveneerimine, fekaaltransplantatsioon