Beetainterferooni signaaliraja aktiivsust mõjutavate geneetiliste variantide tuvastamine
| dc.contributor.advisor | Alasoo, Kaur, juhendaja | |
| dc.contributor.author | Tambets, Ralf | |
| dc.contributor.other | Tartu Ülikool. Loodus- ja täppisteaduste valdkond | et |
| dc.contributor.other | Tartu Ülikool. Arvutiteaduse instituut | et |
| dc.date.accessioned | 2023-09-08T08:21:26Z | |
| dc.date.available | 2023-09-08T08:21:26Z | |
| dc.date.issued | 2021 | |
| dc.description.abstract | Beetainterferoon on inimorganismi põletikuvastuses tähtsal kohal olev biomolekul. See on osa laiast põletikuvastasest geenivõrgustikust, mille toimemehhanism ei ole veel lõplikult selge. Käesolevas töös püüti nelja populatsiooni andmetele tuginedes ülegenoomsete assot-siatsioonuuringute abil tuvastada selle signaaliraja aktiivsust mõjutavaid seni välja selgita-mata geneetilisi variante. Selleks käsitleti beetainterferooni kodeerivas IFNB1 lookuses ole-vaid geneetilisi variante trans-eQTLidena ja selgitati välja nendega kõige tugevamas seoses olev geen. Leitud geeni beetainterferooni signaalraja markergeenina kasutades üritati tuvas-tada täiendavaid signaalraja aktiivsust mõjutavaid trans-eQTLe väljaspool IFNB1 lookust. IFNB1 lookuse seos IFI6 geeniga õnnestus replitseerida nii Fairfax_2014 andmestikus, kus see esmakordselt tuvastati, kui ka ülejäänud kolmel populatsioonil. Lõpliku valimi väiksuse (n=685) tõttu uusi seoseid tuvastada ei õnnestunud. | et |
| dc.identifier.uri | https://hdl.handle.net/10062/92029 | |
| dc.language.iso | est | et |
| dc.publisher | Tartu Ülikool | et |
| dc.rights | openAccess | et |
| dc.rights | Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International | * |
| dc.rights.uri | http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/ | * |
| dc.subject | beetainterferoon | et |
| dc.subject | trans-eQTL | et |
| dc.subject | geeniekspressioon | et |
| dc.subject.other | bakalaureusetööd | et |
| dc.subject.other | informaatika | et |
| dc.subject.other | infotehnoloogia | et |
| dc.subject.other | informatics | et |
| dc.subject.other | infotechnology | et |
| dc.title | Beetainterferooni signaaliraja aktiivsust mõjutavate geneetiliste variantide tuvastamine | et |
| dc.type | Thesis | et |