Browsing by Author "Krigul, Kertu Liis, juhendaja"

Now showing 1 - 3 of 3

Characterization of gut microbiome composition in T2D patients under SGLT2i and GLP1RA treatment
(Tartu Ülikool, 2023) Kazimova, Valida; Org, Elin, juhendaja; Krigul, Kertu Liis, juhendaja
Type 2 Diabetes (T2D) is a globally recognized health concern that has garnered significant research attention. This thesis work focuses on gut microbiome analysis in T2D patients who start taking two medications antidiabetic drugs: Empaglifrozin (SGLT2i) and Semaglutide (GLP1RA). Microbiome composition was analyzed using 16S rRNA sequencing. The research aims to enhance our understanding of how the gut microbiome is related to SGLT2/GLP1 drug intake, potentially leading to the development of personalized treatment approaches for improved patient outcomes.
Eesti jämesoolevähi sõeluuringu patsientide mikrobioomi koosluste erinevused soole koeproovides
(Tartu Ülikool, 2021) Raudsepp, Annabel; Org, Elin, juhendaja; Krigul, Kertu Liis, juhendaja; Tartu Ülikool. Loodus- ja täppisteaduste valdkond; Tartu Ülikool. Molekulaar- ja rakubioloogia instituut
Inimese soolestiku mikrobioota on mitmekesine mikroorganismide kooslus, mis mõjutab meie organismi erinevaid füsioloogilisi protsesse ja tervist. Samas võivad soolestiku mikrobioota muutused mõjutada erinevate komplekshaiguste väljakujunemist. Üks nendest haigustest on jämesoolevähk (CRC), kus mikrobioomi analüüsimine varajases staadiumis esinevatest healoomulistest polüüpidest võib anda olulist teavet jämesoolevähi varajaseks diagnoosimiseks. Töö käigus analüüsiti Eesti jämesoolevähi sõeluuringu raames kogutud jämesoole koeproovide mikrobioomi koosseisu. Tulemustena selgus, et enimesinevad hõimkonnad ja perekonnad on samasugused kõikides koetüüpides peale vähkkoe ning mikroobne mitmekesisus terve epiteel- ja polüübikoe suhtes ei erine. Täpsemate mikroobikoosluste muutuste tuvastamiseks tuleb edaspidi kaasata uuringusse suurem valim koos erinevat tüüpi kogutud proovidega.
Mikroobikoosluse analüüsi võimalikkus Eesti jämesoolevähi sõeluuringus kasutatavatest peitvere testi proovidest
(Tartu Ülikool, 2024) Toodu, Johanna; Krigul, Kertu Liis, juhendaja; Tartu Ülikool. Loodus- ja täppisteaduste valdkond; Tartu Ülikool. Molekulaar- ja rakubioloogia instituut
Jämesoolevähk on levinud kõrge suremusega vähivorm, mille varaseks tuvastamiseks viiakse läbi riiklikke sõeluuringuid. Sõeluuringutes kasutatakse peitvere teste, kus patsiendi väljaheitest mõõdetakse peitverd, mis on jämesoolevähi esinemise tunnuseks. Samas on arvukad uuringud näidanud, et jämesoolevähki põdevatel inimeste soole mikroobikooslus erineb tervete inimeste omast märkimisväärselt. Lisaks peitverele võiks mikroobide analüüsimine peitvere testi tuubidest aidata jämesoolevähki varem ja täpsemalt tuvastada. Antud töös püüti välja selgitada, kas peitvere testi tuubidest on võimalik mikroobikoosluse DNAd eraldada ning sekveneerida, kui selle jaoks kasutada modifitseeritud DNA eraldamise protokolli. Katsete käigus selguski, et mikroobse koosluse tuvastamine on peitvere testidest võimalik. Tulevikus oleks vaja katsetesse kaasata suurem valim, et teha statistiliselt olulisi järeldusi.