Eesti jämesoolevähi sõeluuringu patsientide mikrobioomi koosluste erinevused soole koeproovides

Date

2021

Journal Title

Journal ISSN

Volume Title

Publisher

Tartu Ülikool

Abstract

Inimese soolestiku mikrobioota on mitmekesine mikroorganismide kooslus, mis mõjutab meie organismi erinevaid füsioloogilisi protsesse ja tervist. Samas võivad soolestiku mikrobioota muutused mõjutada erinevate komplekshaiguste väljakujunemist. Üks nendest haigustest on jämesoolevähk (CRC), kus mikrobioomi analüüsimine varajases staadiumis esinevatest healoomulistest polüüpidest võib anda olulist teavet jämesoolevähi varajaseks diagnoosimiseks. Töö käigus analüüsiti Eesti jämesoolevähi sõeluuringu raames kogutud jämesoole koeproovide mikrobioomi koosseisu. Tulemustena selgus, et enimesinevad hõimkonnad ja perekonnad on samasugused kõikides koetüüpides peale vähkkoe ning mikroobne mitmekesisus terve epiteel- ja polüübikoe suhtes ei erine. Täpsemate mikroobikoosluste muutuste tuvastamiseks tuleb edaspidi kaasata uuringusse suurem valim koos erinevat tüüpi kogutud proovidega.

Description

Keywords

mikrobioom, mikrobioota, jämesoolevähk, 16S rRNA sekveneerimine

Citation