Sirvi Märksõna "alphavirus" järgi

Nüüd näidatakse 1 - 10 10

listelement.badge.access-status Avatud juurdepääs ,
Alphaviral nonstructural protease and its polyprotein substrate: arrangements for the perfect marriage
(2012-04-20) Lulla, Aleksei
Alfaviirused (sugukond Togaviridae) on artriiti ja entsefaliiti põhjustavad RNA genoomsed viirused. Nende paljunemise strateegia aluseks on viiruse replikaasi valkude süntees ühe nn. mittestruktuurse eelvalgu P1234 kujul ning selle ajaliselt reguleeritud lõikamine valmis valkudeks nsP2 proteaasi abil. Käesoleva väitekirja aluseks olevad uurimistööd viisid nsP2 substraat-spetsiifilisust tagavate mehhanismide väljaselgitamiseni; muu hulgas kirjeldati uudset proteolüütiliste lõikamiste regulatsioonimehhanismi, mis põhineb liitvalgu erinevate regioonide vahelisel „suhtlemisel“ viiruse replikatsiooni kompleksi moodustamise käigus. Sellest saab järeldada, et P1234 lõikamise ajaline regulatsioon sõltub otseselt replikatsioonikompleksi konfiguratsioonidest, millised omakorda on määratud selle komponentide vaheliste interaktsioonide poolt. Seega tõuseb viiruse nsP2 proteaas esile kui keerulise signaalvõrgustiku keskne element, mille roll viirus infektsiooni regulatsioonis seisneb replikatsiooniga kaasnevate sündmuste „jälgimises“ ja nendele reageerimises. Viimane põhineb sellel, et kui viiruse paljunemine jõuab kindla vahe-etapini, siis kaasneb sellega lõikamiskohtade ja/või muude oluliste struktuuride „esitlemine“ proteaasile, mis reageerib toimunud muudatustele lokaalse signaalülekande, mis lõppkokkuvõttes viib replikaasi kompleksi struktuuri järjestikulistele muudatustele, käivitamisega. Kokkuvõttes, tõid läbiviidud uurimised välja asjaolu, et lisaks varem teada olnud lõikamisjärjestuste äratundmisele, omab ka makromolekulaarsete struktuuride moodustamine viiruse valkude poolt olulist (ja mitmel juhul isegi määravat) rolli viiruse proteaasi töö reguleerimisel. Veel enam, eeldati, et seesugune mitmetahuline regulatsioon võib olla paljukomponentsete proteolüütiliste süsteemide üldine omadus. Kirjeldatud avastused ja nende lahtimõtestamine omavad olulist rolli uurimistöödele, mille eesmärgiks on alfaviiruste paljunemist takistavate lähenemiste väljatöötamine. Nii võib saadud tulemuste põhjal järeldada, et lisaks proteaasi aktiivsuse otsesele mõjutamisele võib viiruse replikatsiooni takistada ka mõjutades proteolüüsi regulatsiooni tagavaid molekulide vahelised seoseid.
listelement.badge.access-status Avatud juurdepääs ,
Biochemical perspective on alphaviral nonstructural protein 2: a tale from multiple domains to enzymatic profiling
(2015-08-31) Das, Pratyush Kumar
Chikungunya viirus (CHIKV) on suure meditsiinilise tähtsusega viirus mis kuulub alfaviiruste perekonda sugukonnas Togaviridae. Pregusel ajal ei ole CHIKV vastast vaktsiini ega spetsiifilist ravi. CHIKV paljunemine nakatatud rakkudes sõltub tema RNA genoomilt sünteesitavatest replikaasi valkudest. NsP2 on nelja replikaasi valgu seas suurim ja tal on palju teadaolevaid või eeldatavaid aktiivsuseid. Käesolevas töös näidati eksperimentaalselt, et CHIKV nsP2 omab kaheahelalist RNAd lahtiharutavat aktiivsust ning võib läbi viia ka vastupidist protsessi – soodustada kaheahelalise RNA moodustamist. Mõlemad need funktsioonid on olemas ainult täispikal nsP2 valgul. Peale selle näidati, et nsP2 omab ka NTPaset ja proteaaset aktiivsust. Kuna ka need aktiivsused on kõige tugevamad täispikal valgul siis saab saadud tulemustest järeldada, et CHIKV nsP2 toimib kui üks tervik: valgu erinevad osad seonduvad omavahel ja mõjutavad vastastikku üksteise aktiivsusi. Lisaks sellele leiti, et nsP2 aktiivsuseid mõjutavad ka mutatsioonid, mis on seotud mitte-tsütotoksilise fenotüübiga st. viiruse võimetusega maha suruda raku biosünteese ja põhjustada raku surma. Siiski ei saa kogutud andmeist teha järeldust milline või millised defektid nsP2 funktsioonides seda fenotüüpi põhjustavad. Lisaks nsP2 funktsionaalsele analüüsile viidi läbi ka muude CHIKV replikaasi valkude ekspresserimine ja puhastamine. Saadud kõrge kvaliteediga valke kasutati efektiivsete polüklonaalsete antiseerumite saamiseks. Nüüdseks on need töövahedid kasutusel paljudes laborites üle maailma ja on võimaldanud välja selgitada palju uusi fakte CHIKV (ja alfaviiruste üldse) molekulaarbioloogia kohta.
listelement.badge.access-status Embargo ,
Construction and functional analysis of stable cell lines expressing nsP1 of alphaviruses
(Tartu Ülikool, 2023) Mirzajani Sarvandani, Mandana; Wang, Sainan, juhendaja; Merits, Andres, juhendaja; Tartu Ülikool. Loodus- ja täppisteaduste valdkond; Tartu Ülikool. Tehnoloogiainstituut
Alphaviruses are positive-strand RNA viruses that are transmitted by mosquitoes and cause various (often serious) diseases in their vertebrate hosts, including humans. Similar to other positive-strand RNA viruses, alphaviruses encode for RNA replicase. RNA replicase of alphaviruses consists of four virus-encoded subunits, called non-structural proteins 1-4 (nsP1-4). nsP1 is a membrane anchor or the replicase complex. It forms a dodecameric ring that holds other components in their place, its guanine-7-methyltransferase (MTase) and guanylyltransferase (GTase) activities are essential for the capping of viral RNA genomes. In this study, tetracycline-inducible stable cell lines expressing nsP1 or its mutants of different alphaviruses were generated. Trans- complementation assay was performed by supplementing homologous or heterologous wild-type nsP1 or its mutant version to functionally defective replicase of Chikungunya virus (CHIKV) in which the defect was caused by mutations of nsP1. We found that expression of wild-type nsP1 of matching or closely related alphaviruses can significantly compensate for capping defects of CHIKV replicase. The compensation was less effective, or not observed at all, for replicase mutants where the defect was due to its compromised membrane attachments. Adding the defective nsP1 to the CHIKV replicase which harbours the same mutation worsens the activity of replicase; however, activities of mutated replicase were restored when it was supplemented with nsP1 harbouring different functional defects. Furthermore, expression of these findings expands our knowledge about alphavirus RNA replication and trans-complementation of replicase-associated defects. Besides, tetracycline-inducible stable cell lines can be used as tools to trans-complement alphaviruses with lethal defects in nsP1 allowing obtaining conditionally infectious alphaviruses virions which can be used at low biosafety level laboratories for high-throughput neutralization and antiviral testing.
listelement.badge.access-status Avatud juurdepääs ,
Development and analysis of novel alphavirus-based multifunctional gene therapy and expression systems
(2013-12-18) Viru, Liane
Alfaviirused on positiivse polaarsusega RNA genoomiga viirused sugukonnast Togaviridea. Looduses levivad alfaviirused lülijalgsete vektorite abil. Selgroogsetel peremeestel põhjustavad nad erinevaid haigusi nagu entsefaliit ja artriit. Tänu oma headele omadustele on alfaviirused kujunenud perspektiivseteks tööriistadeks geeni- ja kasvajavastaste vaktsiinide väljatöötamisel. Uurimus töös kajastati SFV genoomi cDNA-l põhineva infektsioonilise DNA/RNA kihtvektori ning selle alusel valmistatud rekombinantsete vektorite kavandamist, valmistamist ja iseloomustamist. Esmaseks eesmärgiks oli välja selgitada põhjused, mis muudavad pSP6-SFV4 bakterirakkudes geneetiliselt ebastabiilseks. Tehti kindlaks, et seda põhjustab SFV membraanivalkude soovimatust ekspressioonist tulenev toksiline mõju bakterile. See probleem lahendati liites SFV lugemisraami introni, mis takistas toksiliste valkude tootmist bakteris kuid ei mõjutanud negatiivselt loodud DNA/RNA kihtvektorist vabanenud viiruse omadusi. Loodud töövahendit kasutati järgnevates uurimustöödes, mille ühiseks eesmärgiks oli vektorite ohutuse tagamine. Selleks kavandati ja konstrueeriti SFV põhised DNA/RNA kihtvektorid milles rekombinantse SFV genoomi vabanemist takistavad viiruse kodeerivasse alasse sisse viidud defektsed intronid, mis suruvad efektiivselt maha viiruse infektsioonilise RNA vabanemist ja splaisingu mustrit muutvate oligonukleotiidide lisamine vähendab oluliselt või kõrvaldab selliste intronite põhjustatud negatiivse mõju viirus-vektorile. Raku micro-RNAde kasutamine DNA/RNA kihtvektorites võimaldab viiruse paljunemist kontrollida ka peale tema infektsioonilise genoomi vabanemist, mis on saavutatav liites viiruse genoomi raku miRNAde sihtmärk-järjestusi.
listelement.badge.access-status Embargo ,
Induction of type I IFN response by alphavirus replicases in the absence of viral RNA templates
(Tartu Ülikool, 2023) Rutmane, Anna; Omler, Ailar, juhendaja
Alphaviruses are arthropod transmitted viruses with global distribution and wide host range. Upon infection, some alphaviruses may cause acute muscle pain, arthritis, rash, and encephalitis. In the past decades alphavirus-caused epidemics are not uncommon, but despite that there are currently no licensed vaccines or antiviral drugs for any of the alphavirus species. During viral replication and transcription, alphavirus replicase generates 5’-triphosphate RNA and double-stranded RNA (dsRNA), which trigger type I interferon production. Remarkably, it has been shown that SFV and SINV replicases induce IFN- response in absence of viral RNA templates by generating 5’-ppp dsRNA from host cell RNA. In the current work we investigated whether some other alphavirus replicases possess such property and how it differs in human and insect cells. We observed that other alphavirus replicases can generate IFN-inducing RNA without presence of viral RNA templates. We also concluded that correlation between replicase’s ability to transcribe and replicate viral RNA template and its ability to synthesize IFN-inducing RNA from host’s cellular RNA is not universal attribute of all alphaviruses.
listelement.badge.access-status Avatud juurdepääs ,
Role of alphavirus replicase in viral RNA synthesis, virus-induced cytotoxicity and recognition of viral infections in host cells
(2016-05-24) Utt, Age; Merits, Andres, juhendaja; Tartu Ülikool. Loodus- ja täppisteaduste valdkond.
Alfaviirused on positiivse polaarsusega RNA genoomsed viirused. Alfaviiruste levik selgroogsete peremeeste vahel toimub enamasti lülijalgsete vektorite vahendusel. Alfaviiruste perekonda kuulub ka suure meditsiinilise tähtsusega Chikungunya viirus (CHIKV). CHIKV infektsiooni iseloomustab kõrge palavik, lööve ja lihasevalu, eriti iseloomulik on aga liigesevalu, mis võib muutuda krooniliseks ning kesta kuid või isegi aastaid. Praeguseks hetkeks puudub selle viiruse vastane vaktsiin või spetsiifiline ravim, võimalik on leevendada vaid sümptomeid. Kliima muutused ja ülemaailmne reisimine on võimaldanud CHIKV-l levida ka piirkondadesse, kus teda varem ei ole olnud. Näiteks jõudis CHIKV 2013. aasta lõpus Ameerikasse, kus tema levik on võtnud epideemia mõõtmed. Seetõttu on CHIKV uurimine intensiivistunud, kuid siiski on tema kohta käivad teadmised lünklikud ja ebapiisavad. Selleks, et välja töötada CHIKV vastaseid vaktsiine või ravimeid tuleb esmalt põhjalikult uurida tema molekulaarbioloogiat ja, mis veelgi olulisem, mõista kuidas CHIKV ja tema peremees teineteist vastastikku mõjutavad. Paraku on tegemist ohtliku patogeeniga, mille töötamine on raskendatud kõrgest bioohutuse tasemest tulenevate tingimuste tõttu. Seetõttu on CHIKV uuringuteks eriti vajalikud ohutud ja samas ka efektiivsed tööriistad. Seega antud uurimustöö eesmärgiks saigi selliste tööriistade väljatöötamine, mis hõlbustaksid CHIKV uurimist. Esmalt konstrueerisime mittetsütotoksilised CHIKV replikonid, mis võimaldavad neid sisaldavate rakkude järjepidevat paljunemist. Töö käigus loodi püsiliinid ja tehti kindlaks erinevad mutatsioonide kombinatsioonid nsP2 valgus, mis vähendasid CHIKV replikoni tsütotoksilisust. Iseloomustati ka mutatsioonid nsP1 ja nsP3 valkudes, mis võimaldasid mittetsütotoksilise CHIKV replikoni püsimist inimese rakkudes. Läbiviidud analüüsid näitasid, et mutatsioonid nsP2 valgus mõjutavad selle ensümaatilisi aktiivsuseid ning vähenenud tsütotoksilisusega fenotüübid erinevad molekularsete mehhanismide poolest. Lisaks leiti, et sellised stabiilsed ja markervalke tootvad rakuliinid kujutavad endast efektiivseid ja ohutuid tööriistu, mis võimaldavad CHIKV vastaste inhibiitorite otsimist ja nende toime analüüsimist. Teiseks töötasime välja uudse CHIKV põhise trans-replikaasi süsteemi, kus replikaasi valkude tootmine ja nende poolt läbiviidav RNA paljundamine on teiseteisest lahutatud. Näitasime, et selline süsteem võimaldab uurida erinevate mutatsioonide või mittestruktuursetele valkudele lisatud tagide otseseid efekte replikaasi võimele läbi viia RNA sünteesi. Võrrelduna infektsioonilise viirusega omab CHIKV trans-replikaas sellistes analüüsides selgeid eeliseid, sest viiruse kontekstis põhjustavad paljud mutatsioonid geneetilist ebastabiilsust. Lisaks leidsime, et konstueeritud trans-replikaasi süsteem võimaldab väga edukalt uurida viiruse ja peremeesraku vahelisi interaktsioone. SFV trans-replikaasi kasutades avastasime alfaviiruste replikaasi uue funktsiooni – võime kasutada rakulisi RNAsid sünteesimaks kaasasündinud immuunvastust aktiveerivaid kaheahelalisi RNA molekule. Samas aga selgus huvitav tõsiasi, et CHIKV replikaas ei ole võimeline meie poolt kirjeldatud viisil immuunsüsteemi aktiveerima. Seega leidsime, et kahe väga sarnase alfaviiruse äratundmine peremeesraku poolt toimub väga erineval moel. Käesoleva uurimustöö käigus on loodud rida unikaalseid ja efektiivseid CHIKV molekulaarbioloogia uurimise tööriistu. Nende kasutamine on võimaldanud paremini mõista nii CHIKV molekulaarbioloogiat kui ka alfaviirus - peremees vahelisi interaktsioone.
listelement.badge.access-status Avatud juurdepääs ,
Stable expression of Barmah Forest virus replicons in cultured mammalian cells
(Tartu Ülikool, 2023) Sultanova, Aylin; Omler, Aliar, juhendaja
Viruses are infectious agents that can infect various living organisms, including humans, animals, plants, and microorganisms. Understanding their molecular biology is crucial for developing effective prevention and treatment strategies. Alphaviruses are a group of mosquito-borne viruses that cause diseases such as rash, arthritis, and encephalitis. Barmah Forest virus (BFV) is an alphavirus that poses a public health threat in Australia. However, research on BFV is relatively limited compared to other alphaviruses. In this study, we focus on the expression of BFV replicons in cultured mammalian cells. Replicons are valuable tools for studying viral replication and developing antiviral agents. We review the successful generation of replicons for alphaviruses and Hepatitis C virus and propose a workflow for constructing BFV replicons in cultured mammalian cells.
listelement.badge.access-status Avatud juurdepääs ,
Studies on inducible alphavirus-based antitumour strategy mediated by site-specific delivery with activatable cell-penetrating peptides
(2015-08-04) Pärn, Kalle
Kasvajate ravi on tänaseni osutunud suureks väljakutseks nii arstidele, kes tegelevad otsese raviga, kui ka teadlastele, kes erinevaid terapeutilisi lähenemisi välja töötavad. Kirurgiline sekkumine on enimrakendatud lähenemine vähiravis, mida tihtipeale kombineeritakse nii kiirituse kui ka kemoteraapiaga, kuid kahjuks näeme siiani suurt hulka patsiente, kellel tekib kasvaja mõne aja pärast uuesti. Siinkohal tuleb hakata mõtlema uudsetele lahendustele – äkki ei piisa ainult sellest, et toimetada sobiv ravimolekul kasvajasse ja lasta seal mõjuda, kas on olemas ka mõni teine lähenemine? Uurimustöös pakuti välja seni proovimata uudne lahendus kemoteraapiasüsteemi loomiseks, mis koosneb kahest erinevast osast. Palju on räägitud erinevate geenijärjestuste transpordist haigetesse kudedesse, eesmärgiga neid ravida, kuid palju vähem kõlapinda on saanud geneetiliselt modifitseeritud viiruste kasutamine sarnaseks eesmärgiks. Kuna tegemist on ikkagi kasvajarakkudega, ei ole neid praeguste tehnoloogiate juures enam võimalik tagasi normaalseteks rakkudeks muuta, seega ei ole ka nende ellu jäämine väga oluline. Siinkohal tulevadki mängu viirused, mille heaks näiteks on alfaviiruste hulka kuuluv Semliki Forest viirus. Sellise viiruse kasvajarakku sisestamine võimaldaks saavutada kaks eesmärki korraga: esiteks oleks viiruse genoomi sisestatud järjestuselt võimalik toota terapeutilise efektiga valke, teiseks võimaldab viiruse omadus oma peremeesrakk hävitada, efektiivselt võidelda kasvajarakkudega. Samas ei ole kõik nii lihtne, nagu esmapilgul tundub, kuna viirustel on tihtipeale omadus hakata oma peremeesorganismis paljunema, mille tagajärjeks on nakatumine. Selle piiramiseks on välja mõeldud kontrollsüsteem, mis moodustab ka ravimehhanismi esimese poole, mille puhul sisestatakse viirustesse defektsed intronid, mis võimaldavad neil paljuneda ainult sellistes rakkudes, mis sisaldavad aktiveerivat molekuli, mis neid siis läbi defekti blokeerimise sisse lülitab. Antud süsteemi täielikult toimimiseks on vaja ka teist poolt, ehk siis efektiivset meetodit nii eelpool mainitud viiruse kui ka selle aktivaatori transpordiks soovitud rakkudesse, mis antud kontekstis on kasvajarakud. Selle saavutamiseks modifitseeriti ühte rakku sisenevat peptiidi (klass efektiivseid ja võrdlemisi ohutuid transpordimolekule), milleks oli PepFect14. Kuna antud molekul oli eelnevalt demonstreerinud suutlikkust transportida erinevaid lastmolekule erinevatesse kudedesse, eelistatuna kopsu, siis tuli esmalt leida moodus aktiivsuse maha surumiseks. Selleks kasutati molekuli, PEG, mis käitub nagu kaitsekilp, takistades peptiidil erinevate rakkudega kontakti astumast. Siinkohal võib tekkida küsimus, et kuidas molekuli varjestamine aitab kaasa kasvajarakkudesse jõudmisele, kas nimetatud molekul ei blokeeri kõiki funktsioone ära? Lahenduseks on „kilbi“ kinnitamine läbi sellise vahelüli, mis lagundatakse spetsiifiliste kasvajarakkude keskkonnas avalduvate ensüümide poolt, muutes eelnevalt uinunud olekus süsteemi aktiivseks ainult kasvajakoes, võimaldades kompleksidel (transportiv peptiid ning selle lastiks olev viiruse järjestus või siis aktiveeriv molekul) seeläbi valikuliselt kasvajarakkudesse siseneda. Kokkuvõttes võimaldab antud strateegia tappa kasvajakudesid kontrollitava viirusega, mis samas toodab ravimolekule, mis, sõltuvalt täpsest funktsioonist, kas stimuleerivad immuunsüsteemi või toimivad mõnda muud rada pidi. Kindlustamaks, et viirus ja selle aktiveerimiseks vaja minev molekul jõuaksid just kasvajatesse ja mitte kuhugile mujale, on nende transpordiks rakendatud kasvajate poolt aktiveeritav peptiidil põhinev geenitranspordisüsteem.
listelement.badge.access-status Embargo ,
The novel trans-complementation system for chikungunya virus
(Tartu Ülikool, 2024) Makhotina, Anna; Merits, Andres, juhendaja; Naumenko, Krystyna, juhendaja; Wang, Sainan, juhendaja; Tartu Ülikool. Loodus- ja täppisteaduste valdkond; Tartu Ülikool. Tehnoloogiainstituut
Alphaviruses (Togaviridae) are mosquito transmitted positive-sense RNA viruses that cause severe and sometimes even lethal diseases in their vertebrate hosts. Numerous outbreaks have been brought on by alphaviruses worldwide in the last few decades. Chikungunya virus (CHIKV) stands out as a major global health concern due to recurrent outbreaks and debilitating chronic arthralgia caused by CHIKV infection. The arthralgia might be due to the persistent replication of CHIKV. CHIKV non-structural protein 4 (nsP4) is the RNA-dependent RNA polymerase (RdRp), which enables the replication of the viral genome and therefore plays a critical role in virus infection. In this work, we established the inducible stable cell lines for CHIKV nsP4 expression. NsP4 expressed in these cells can functionally trans-complement CHIKV mutant genomes harboring lethal mutations in nsP4 or lacking the nsP4 region entirely. This system enables the production of CHIKV virions that are infectious for nsP4 expressing cell lines but limited to early stages of infection (attachment, internalization, and replicase protein expression) in other cells. Moreover, our system was found to be suitable for the analysis of compounds inhibiting CHIKV replication; for example, RdRp inhibitor 4’-Fluorouridine significantly inhibited viral replication in nsP4 expressing cells. Additionally, our study revealed that CHIKV nsP4 can form functional replicases with P123 polyproteins of heterologous alphaviruses using trans-replication assay. This finding expands the versatility of the CHIKV nsP4 stable cell lines. We extended these findings and constructed inducible cell lines that express both nsP1 and nsP4 components of replicase and demonstrated that these cells can complement for lethal defects introduced into both nsP1 and nsP4 of the CHIKV genome. Taken together, CHIKV nsP4 inducible stable cell lines are valuable tools for alphavirus research, can be used to produce virions that are infections only in specific cell lines and therefore be handled without biosafety risk, such tools open new possibilities for studies of alphavirus replication as well as for screening and analysis of inhibitors of alphavirus replication.
listelement.badge.access-status Avatud juurdepääs ,
Towards understanding the neurovirulence of Semliki Forest virus
(2015-11-16) Saul, Sirle; Merits, Andres, juhendaja; Žusinaite, Eva, juhendaja; Tartu Ülikool. Loodus- ja tehnoloogiateaduskond
Semliki Forest viirus (SFV) on positiivse polaarsusega RNA genoomiga viirus, mis kuulub alfaviiruste perekonda sugukonnas Togaviridae. Alfaviiruste seas leidub mitmeid inimese ja loomade patogeene, mille poolt põhjustatavad haigused varieeruvad külmetuse sarnaste sümptomitega tõvest aastaid kestva artriidi või fataalse entsefaliidini. SFV-d on laialdaselt kasutatud nii alusuuringutes kui ka mudelobjektina viirusliku entsefaliidiga kaasneva patogeneesi uurimisel. Kõige põhjalikumalt uuritud SFV tüvedeks on A7(74), SFV4 ja L10. A7(74) on avirulentne tüvi, mis põhjustab täiskasvanud hiires asümptomaatilist infektsiooni. SFV4 ja L10 on aga virulentsed tüved, sest otse ajju või kõrge doosiga kõhuõõnde süstituna põhjustavad nad hiirtel surmaga lõppevat entsefaliiti. Madalama viiruse koguse kasutamise korral ei jõua SFV4 ajju ning nakatatud katseloomad jäävad ellu. Käesolev uurimistöö näitas, et SFV4 ja L10 vahelised erinevused hiires on tingitud viiruse ümbrisevalgu (E2) aminohappejääkide laengutest. Positiivse laenguga lüsiinijäägid E2 valgus soodustavad küll viiruse seondumist koekultuuri rakkudele, kuid põhjustavad in vivo tingimustes SFV4 virionide efektiivse seostumise raku pinnaretseptori heparaansulfaadiga, mis vähendab viiruse taset veres ja selle kaudu võimekust ajju siseneda. Me näitasime, et erinevused A7(74) ja L10 neurovirulentsuses on tingitud erinevustest viiruse mittestruktuurse liitvalgu proteolüütilise lõikamise kiiruses ning mittestruktuurse valgu 3 (nsP3) järjestuses. P123 liitvalgu 1/2 lõikamisjärjestuse aeglane protsessimine või L10 nsP3 valgu olemasolu suurendavad SFV replikaasi võimet indutseerida interferooni tootmist, korreleerudes viiruse võimega levida hiire ajus, mis viitab seosele SFV neurovirulentsuse ja immunopatoloogia vahel. Viiruse ja peremehe vahel esinevate keeruliste interaktsioonide veel täpsemaks uurimiseks arendasime välja uue lähenemise, mis võimaldas tuvastada SFV replikatsioonikompleksidega seonduvaid rakulisi valke. Käesoleva uurimistöö käigus saadud tulemused aitavad ühelt poolt paremini mõista SFV neurovirulentsust, lisaks sellele on mudelviiruse uurimisel kasutatud meetode ja avastatud seaduspärasusi võimalik rakendada ka inimesele ohtlike alfaviiruste uurimiseks.