Vigadega sekveneerimisandmete analüüs. Sekveneerimiskatvuse hindamine

Lühendatud kirje lehekülg
dc.contributor.advisorMöls, Märt, juhendaja
dc.contributor.authorKippar, Kätlin
dc.contributor.otherTartu Ülikool. Matemaatika ja statistika instituutet
dc.contributor.otherTartu Ülikool. Loodus- ja täppisteaduste valdkondet
dc.date.accessioned2024-07-01T12:12:07Z
dc.date.available2024-07-01T12:12:07Z
dc.date.issued2024
dc.description.abstractKäesoleva bakalaureusetöö eesmärk on võrrelda aritmeetilise keskmise ja Poissoni segumudeli täpsust keskmise sekveneerimiskatvuse hindamisel erindite olemasolu korral. Simuleeritakse erindeid sisaldavaid andmed, leitakse mõlema meetodi hinnangud ning otsitakse erindite osakaalu, millest alates üks meetod teisest täpsemaks muutub. Töös antakse ülevaade sekveneerimisest ning sellega kaasnevatest bioloogiamõistetest, kirjeldadakse vajalikku metoodikat ning saadud tulemusi. Tulemuseks leiti 9 meetodite lõikumispunkti erinditele vastava parameetri erinevate väärtuste korral. Tulemused näitavad enamikul juhtudest Poissoni segumudeli kasutamise olulisust erindite osakaalu kasvades.et
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/10062/100465
dc.language.isoet
dc.publisherTartu Ülikoolet
dc.rightsAttribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 Estoniaen
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/ee/
dc.subjecttõepärasuhte testet
dc.subjectPoissoni segumudelet
dc.subjectsuurima tõepära hinnanget
dc.subjectsegujaotuset
dc.subjectsekveneerimiskatvuset
dc.subjectlugemet
dc.subjectsekveneerimineet
dc.subjectgenoomet
dc.subjectlikelihood ratio testen
dc.subjectPoisson mixture modelen
dc.subjectmaximum likelihood methoden
dc.subjectmixture distributionen
dc.subjectsequencing coverageen
dc.subjectreaden
dc.subjectsequencingen
dc.subjectgenomeen
dc.subject.otherbakalaureusetöödet
dc.subject.othervõrguväljaanded
dc.titleVigadega sekveneerimisandmete analüüs. Sekveneerimiskatvuse hindamineet
dc.typeThesisen

Failid

Originaal pakett

Nüüd näidatakse 1 - 1 1
Pisipilt
Nimi:
katlin_kippar_bsc_2024.pdf
Suurus:
816.44 KB
Formaat:
Adobe Portable Document Format
Lae alla

Kollektsioonid

LTMS bakalaureusetööd - Bachelor's theses.