Vanas DNAs leiduva saastuse tuvastamine vanade ja kaasaegsete mitogenoomide võrdlusanalüüsi abil

Abstract

Vana DNA (ancient DNA, aDNA) on surnud organismide kudedest eraldatud geneetiline materjal. Vana DNA järjestustest saadakse vahetut informatsiooni paljude kunagi elanud liikide geneetilise mitmekesisuse kohta, eriti palju teaduslikke töid on seotud inimese ja tema eellaste uurimisega. Üks DNA omadusi on selle ebastabiilsus: aja jooksul suurenevad selle lagunemisaste ja keemilise modifitseerituse määr. Need protsessid raskendavad vana DNA analüüsi efektiivsust võrreldes kaasaegse DNAga. Arheoloogiliste proovide saastumine kaasaegse geneetilise materjaliga on olnud suureks probleemiks kogu vana DNA uurimisajaloo vältel. Käesoleva töö eesmärgiks on DNA eraldamine Tartu Ülikooli arheoloogide bioloogilisest materjalist, arheoloogide mitokondriaalse DNA (mtDNA) fülogeneetiline analüüs ning kaasaegsete ja vanade mtDNA järjestuste võrdlusanalüüs kompleksse saastuse tuvastamise protseduuri osana.