E.coli 23S rRNA V domeeni modifikatsioonid ja nende mõju ribosoomi biosünteesile

Abstract

Ribosoomi funktsiooniks on valgusüntees, see koosneb suurest ja väikesest subühikust ning ribosomaalsest RNA’st (rRNA) ja ribosoomi valkudest (r-valgud). Kõikide organismide ribosomaalne rRNA sisaldab suuremal või vähemal määral modifitseeritud nukleotiide. Modifitseeritud nukleotiididide positsioonid ning modifikatsioonide arv on erinevate organismide lõikes varieeruv. E.coli ribosoomi 36 modifikatsioonidest 13 on koondunud 23S rRNA V domeeni. V domeenis asub peptidüültransferaasne tsenter (PTC), mis on ribosoomi katalüütiliseks tsentriks, kus toimub peptiidsideme süntees. Vaatamata sellele, et modifikatsioonide täpne funktsioon on teadmata, asub enamik modifikatsioonidest funktsionaalselt olulistes kohtades. mis osutab nende tähtsusele