Muropeptiidide poolt indutseeritud statsionaarsest faasist väljumisega seotud geenide tuvastamine bakteris Escherichia coli

Abstract

Bakterid elavad kasvuks ebasoodsaid tingimusi üle metaboolselt inaktiivses soikeseisundis. Kui elutingimused paranevad, on nad võimelised kasvu jätkama ning kasvavad bakterid vabastavad ümbritsevasse keskkonda peptidoglükaani fragmente ehk muropeptiide, mis on signaaliks ülejäänud soikeseisundis bakteritele. Escherichia coli on üks bakteriliikidest, kes on võimeline soikeseisundist väljuma vastusena muropeptiididele. Käesoleva töö eesmärk oli välja töötada katsesüsteem, mis võimaldab identifitseerida geenid, mis on seotud muropeptiididest sõltuva soikeseisundist väljumisega. Välja õnnestus töötada katsesüsteem, mis võimaldab läbi viia suuremahulist Keio kollektsiooni skriinimist, et leida potentsiaalseid mutante, mis muropeptiididele ei reageeri