Kuulmislangusega seotud mitokondri RNR1 geenimutatsioonide re-sekveneerimine rakuvabast DNA-st

Abstract

Kuulmislangust põhjustavad kolm mutatsiooni mitokondri RNR1 geenis: m.1095T>C, m.1494C>T ja m.1555A>G. Need mutatsioonid muudavad 12S rRNA järjestuse mitokondris sarnaseks prokarüoodi 16S rRNA järjestusele, mis põhjustab aminoglükosiidide paremat seondumist ning ototoksilisust. Käesolevas töös uuriti mitteinvasiivse prenataalse testimise (NIPT) tulemustes mutatsioonide esinemissagedust täiendava PCR-amplifikatsiooni ja re-sekveneerimise läbi. Mutantne alleel kinnitati, kui selle osakaal kõigist lugemitest sekveneerimistulemustes ületas 50%. Kolme mutatsiooni kumulatiivne esinemissagedus oli 0,23%. Re-sekveneerimise kinnituse abil oli võimalik NIPT tulemustest eemaldada valepositiivsed tulemused ja kinnitada tõelised mutatsiooniga proovid 100% spetsiifilisusega. Mutatsiooni kajastamine elektroonilistes terviseandmetes aitab vältida aminoglükosiidide manustamisest põhjustatud kuulmislanguse teket riskialleelidega patsientidel.