Taksonoomiliste profiilide visualiseerimine

Abstract

Metagenoomika on oluline mitmes valdkonnas, nagu meditsiin ja keskkonnateadus, võimaldades mõista mikroobikoosluste geneetilist ja funktsionaalset mitmekesisust. Töö eesmärk oli võrrelda taksonoomiliste profiilide visualiseerimise tööriistu ning hinnata, kuidas andmestiku ülesehitus ja programmide funktsioonid mõjutavad diagrammide kujundust. Krona diagramm oli informatiivne ja interaktiivne, Paviani Sankey diagrammid selged ja ühetasandilised, kuid kumbki ei võimaldanud värvimist. Tableau Public mullidiagrammid olid lihtsad, ent infovaesed. Mullidiagrammides kujutati liike, lugemeid ja patogeensust; toiduandmestikus eristati taimi ja putukaid värvuse alusel.