Viiruste poolt kasutatavad strateegiad translatsiooni reguleerimiseks

Abstract

Viirused ei kodeeri oma väikese genoomi tõttu translatsiooniaparaati. Viiruse genoomi paljundamine sõltub seega peremehe ribosoomidest. Efektiivse valkude sünteesi tagamiseks peavad viirused peremeesrakuga võistlema. Viirusvalkude sünteesi reguleerimiseks kasutavad viirused erinevaid strateegiaid. Käesoleva töö esimeses osas uuriti, milliste efektiivsustega toimub sisemiste ribosoomi seondumise järjestuste (IRES) vahendatud translatsiooni initsiatsioon erinevasse klassi kuuluvatel VI tüübi IRES-tel S. cerevisiae metsiktüüpi rakkudes. Lisaks määrati erinevate VI tüübi IRES-te efektiivsus S. cerevisiae tüves, mille ribosoomide subühikute vahelist interaktsiooni on modifitseeritud. Töö teises osas ekspresseeriti ja puhastati viiruse proteaas. Lisaks disainiti, ekspresseeriti ja puhastati mudelsubstraat, et teha kindlaks proteaasi aktiivsus ning spetsiifilisus. Selle süsteemi abil testiti viiruse proteaasi võimet protsessida ribosomaalseid valke in vitro.