Akvaporiinide roll taimede veevahetuses ja peamiste neid kodeerivate geenide fragmentide järjestuste analüüs kolmes odrasordis (Hordeum vulgare)

Abstract

Akvaporiinid on transmembraansed poore moodustavad valgud, mis mängivad olulist rolli mitmetes taime eluks vajalikes protsessides. Üheks tähtsamaks neist on veevahetus, mille käigus taim omastab mullast vett, toimub selle transport läbi taimeosade ning viimaks vabastatakse üleliigne õhulõhede kaudu atmosfääri. Käesoleva töö esimeses osas antakse ülevaade veevahetuse ja akvaporiinide teoreetilisest taustast. Eksperimentaalses osas kirjeldatakse katseid, mis viidi läbi, et võimaldada kolme hariliku odra sordi (Hordeum vulgare L. ’Golden Promise’, Hordeum vulgare L. ’Vanille’ ja Hordeum vulgare L. ’Marta’) valitud akvaporiinide geeniekspressiooni analüüsi. Selleks paljundati nende geenide fragmendid PCR-iga ja sekveneeriti ning võrreldi saadud järjestusi referentsgenoomiga ja omavahel. Seejärel hinnati, kas saadud järjestuste põhjal on võimalik disainida kõikidele sortidele sobivaid praimereid qPCR-i läbi viimiseks.