Kromosoomsete profaagide ja toksiini-antitoksiini süsteemide roll Pseudomonas putida faagiresistentsuses

Abstract

Profaagid kaitsevad peremeesbakterit sarnaste bakteriofaagidega nakatumise eest. Sama on spekuleeritud ka toksiini-antitoksiini süsteemide kohta. Käesoleva töö eesmärk oli välja selgitada, kas kromosoomsed profaagid ja toksiini-antitoksiini (TA) süsteemid mõjutavad P. putida vastupanuvõimet faagidele. Selle eesmärgi saavutamiseks eraldasin keskkonnaproovist P. putida’t nakatava faagi Pp_F2 ja optimeerisin faagide isoleerimise metoodikat. Faagidega Pp_F1 ja Pp_F2 läbi viidud nakatamiskatsed näitavad, et P. putida kromosoomsed profaagid kaitsevad bakterit faagiga nakatumise eest. Kromosoomsed TA süsteemid ei suurenda, vaid pigem vähendavad P. putida kohasust faagirünnaku korral. Nii kromosoomsed profaagid kui ka TA süsteemid mõjutavad P. putida faagiresistentsust erineval määral, sõltuvalt ründavast faagist. Faagide isoleerimise metoodika optimeerimisel selgus, et P. putida on faaginakkusele vastuvõtlikuim eksponentsiaalses kasvufaasis, temperatuuril 20°C ja DNA stressi põhjustava antibiootikumiga inkubeerimisel.