Bakteriofaagide morfoloogia bioinformaatiline ennustamine ja eksperimentaalne tuvastamine

Abstract

Bakteriofaagide morfoloogia on oluline tunnus, mis on seotud nende klassifikatsiooni ja struktuuriga. Faagide morfoloogia uurimiseks kasutatakse läbivalgustavat elektronmikroskoopiat. Kui ajalooliselt oli see peaaegu ainus võimalus morfoloogia määramiseks, siis tänapäeval saab morfoloogiat ennustada ka bioinformaatiliste meetodite abil genoomiandmete põhjal. Käesoleva töö eesmärk oli ennustada bakteriofaagide morfoloogiat bioinformaatiliste meetodite abil ning võrrelda tulemusi eksperimentaalselt määratud morfoloogiaga. Eesmärgi saavutamiseks analüüsiti bakteriofaagide genoomijärjestusi ning tuvastati morfoloogiaga seotud struktuurvalke kodeerivad geenid. Nende põhjal ennustati faagide võimalik morfoloogia. Eksperimentaalseks tuvastamiseks määrati faagide morfoloogia läbivalgustava elektronmikroskoopia abil. Tulemused näitasid, et bioinformaatilised meetodid võimaldavad teha usaldusväärseid järeldusi bakteriofaagide morfoloogia kohta, kuid täpsemaks määramiseks on vajalik eksperimentaalne kinnitamine.