Geeni lapG transkriptsiooni regulatsioon Pseudomonas putida’s

Abstract

Käesolevas töös uuritakse Pseudomonas putida geeni lapG ning PP_0163 transkriptsiooni regulatsiooni sõltuvust sigmafaktorist RpoS, globaalsest regulaatorist Fis ja keskkonnas olevast fosforist. P. putida on risosfäärne bakter, mis eelistab elada biofilmina taimejuurtel, kuna seal on rohkem toitaineid, kui risosfäärist kaugemal olevas mullas. Varasemalt on uuritud põhjalikult P. putida biofilmi jaoks oluliste lap geenide, nagu lapA posttranskripsioonilist regulatsiooni ning lapE transkriptsioonilist regulatsiooni. Samas, LapG puhul on uuritud posttranslatsioonilist regulatsiooni kuid vähem lapG transkriptsiooni. Käesolevas töös leiti, et lapG promootor(id) asub/asuvad geenidevahelisel alal ning geenil PP_0163 võib olla isegi kaks promootorit, millest üks asub geenidevahelisel alal, teine lapG-s