Eestis isoleeritud Klebsiella pneumoniae kliiniliste tüvede antibiootikumiresistentsuse tuvastamine sekveneerimisandmetest programmiga DeepARG

dc.contributor.advisorBrauer, Age,juhendaja
dc.contributor.authorMonso, Kethel
dc.contributor.otherTartu Ülikool. Loodus- ja täppisteaduste valdkondet
dc.contributor.otherTartu Ülikool. Molekulaar- ja rakubioloogia instituutet
dc.date.accessioned2025-08-05T06:46:53Z
dc.date.available2025-08-05T06:46:53Z
dc.date.issued2025
dc.description.abstractAntibiootikumiresistentsus on üheks suurimaks globaalseks probleemiks, põhjustades patsientide pikemajalist ravi, kõrgemat suremust ning suuremaid ravikulusid. Ligikaudu kolmandik gramnegatiivsete bakterite põhjustatud haigustest on seotud Klebsiella pneumoniae’ga. Käesolevas töös analüüsitakse DeepARG programmi võimekust ennustada Eestis levivate K. pneumoniae tüvede resistentsusfenotüüpe, võrreldes programmiga ResFinder. Töö tulemusena järeldati, et üldiselt on kõige spetsiifilisem DeepARG-LS mudel ning kõige sensitiivsemad on DeepARG-SS ja ResFinder. Programmide PPV sõltus palju antibiootikumist.
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/10062/112338
dc.language.isoet
dc.publisherTartu Ülikoolet
dc.rightsAttribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 Estoniaen
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/ee/
dc.subjectantibiootikumiresistentsus
dc.subjectKlebsiella pneumoniae
dc.subjectbioinformaatika
dc.subject.otherbakalaureusetöödet
dc.titleEestis isoleeritud Klebsiella pneumoniae kliiniliste tüvede antibiootikumiresistentsuse tuvastamine sekveneerimisandmetest programmiga DeepARG
dc.typeThesisen

Failid

Originaal pakett

Nüüd näidatakse 1 - 1 1
Laen...
Pisipilt
Nimi:
Kethel Monso.pdf
Suurus:
11.76 MB
Formaat:
Adobe Portable Document Format