Pseudomonas putida GraA antitoksiini lagundava proteaasi otsinguil

Abstract

Toksiin-antitoksiin süsteemid on bakterites laialt levinud kahekomponendilised moodulid, mida seostatakse üldise stressivastuse regulatsiooni, faagivastase kaitse ja biofilmi moodustamisega. Toksiin-antitoksiin süsteemid mõjutavad raku kasvu toksiini aktiivsuse vahendusel. Normaalse kasvu juures on toksiin seotud temale vastava antitoksiiniga ja toksiini aktiivsus on seeläbi neutraliseeritud. Üks Pseudomonas putida toksiin-antitoksiin süsteemidest on GraTA, kus GraA on antitoksiin ja GraT on toksiin. GraT aktiveerimiseks lagundatakse GraA toksiin-antitoksiin süsteemidele ebatavaliselt endoproteolüütiliselt. Käesolevas töös otsisin transposoonmutageneesiga geeni, mis kodeerib GraA-d lagundavat proteaasi. Kuna mul ei õnnestunud ühtegi sellist geeni identifitseerida, viitab see, et GraA-d lagundav proteaas on rakule elutähtis. Siiski õnnestus uudsete leidudena identifitseerida GacS/GacA süsteemi ja energiametabolismi seosed GraTA regulatsiooniga.