Karbapeneemresistentsuse ennustustäpsuse võrdlus Klebsiella pneumoniae isolaatidel kolme bioinformaatilise tööriistaga: PhenotypeSeeker, ResFinder, Kleborate

Lühendatud kirje lehekülg
dc.contributor.advisorRemm, Maido, juhendaja
dc.contributor.advisorRiit, Taavi, juhendaja
dc.contributor.authorHelde, Karita
dc.contributor.otherTartu Ülikool. Loodus- ja täppisteaduste valdkondet
dc.contributor.otherTartu Ülikool. Molekulaar- ja rakubioloogia instituutet
dc.date.accessioned2025-08-04T06:28:42Z
dc.date.available2025-08-04T06:28:42Z
dc.date.issued2025
dc.description.abstractAntimikroobne resistentsus (AMR) on kasvav rahvatervise probleem, mida süvendab antibiootikumide liigne ja vale kasutamine. Tõhusaks raviks on vajalik resistentsuse kiire ja täpne tuvastamine. Üheks paljulubavaks lähenemiseks on bakteri isolaatide resistentsusprofiili määramine täisgenoomi sekveneerimise (WGS – whole genome sequencing) abil. Magistritöö kirjanduse ülevaates kirjeldatakse AMR-i ja karbapeneemresistentsuse levikut Klebsiella pneumoniae isolaatide seas. Töö praktilises osas võrreldi kolme bioinformaatilise tarkvara – ResFinder, Kleborate ja PhenotypeSeeker – suutlikkust ennustada CRKP isolaatide resistentsust meropeneemile, ertapeneemile ja imipeneemile, kasutades WGS andmeid. Lisaks hinnati tööriistade täpsust Eesti haiglatest pärit K. pneumoniae isolaatidel.
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/10062/112284
dc.language.isoet
dc.publisherTartu Ülikoolet
dc.rightsAttribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 Estoniaen
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/ee/
dc.subjectantimikroobne resistentsus
dc.subjectkarbapeneemresistentsus
dc.subjectKlebsiella pneumoniae
dc.subjectResFinder
dc.subjectKleborate
dc.subjectPhenotypeSeeker
dc.subject.othermagistritöödet
dc.titleKarbapeneemresistentsuse ennustustäpsuse võrdlus Klebsiella pneumoniae isolaatidel kolme bioinformaatilise tööriistaga: PhenotypeSeeker, ResFinder, Kleborate
dc.typeThesisen

Failid

Originaal pakett

Nüüd näidatakse 1 - 1 1
Pisipilt
Nimi:
Karita Helde.pdf
Suurus:
3.85 MB
Formaat:
Adobe Portable Document Format
Lae alla

Kollektsioonid

MRI magistritööd – Master's theses