Lipiidide ainevahetusega seotud geeni GPAT3 ekspressiooni regulatsioon transkriptsioonifaktori ATF4 poolt

Abstract

Lipiidid sünteesitakse endoplasmaatilises retiikulumis (ER). Toksilise toime vältimiseks säilitatakse üleliigseid lipiide rakus lipiiditilgakestena, mis samuti moodustuvad ER-is. Lipiiditilgakeste biogeneesil osaleb ensüüm GPAT3, mis katalüüsib tilgakeste koostisse kuuluvate triglütseriidide sünteesi. Käesoleva töö eesmärk on uurida raku stressivastuses osaleva transkriptsioonifaktori ATF4 rolli GPAT3 geeni ekspressioonil. Selgus, et GPAT3 ekspressioon suureneb ER stressi indutseerimisel. Reporterkatsed näitasid, et lisaks promootorpiirkonnale aktiveerib transkriptsiooni ER stressi käes kannatavates rakkudes ja ATF4 üleekspressiooni toimel GPAT3 intronis paiknev DNA lõik, mis sisaldab ATF4 seondumissaiti. Selle DNA piirkonna väljalõikamisel rakkude genoomist CRISPR-Cas9 abil GPAT3 mRNA tase langeb, mis viitab ATF4 rollile GPAT3 ekspressiooni reguleerimisel ka intronis paikneva saidi vahendusel.