Kõrge läbilaskevõimega sekveneerimise rakendamine viiruste tuvastamiseks Eesti seemnekartulis ja kartuli Y-viiruse tüvede identifitseerimine bioinformaatiliste meetoditega

Lühendatud kirje lehekülg
dc.contributor.advisorvan der Sman, Piret, juhendaja
dc.contributor.advisorPuurand , Tarmo, juhendaja
dc.contributor.authorStražev, Anette
dc.contributor.otherTartu Ülikool. Loodus- ja täppisteaduste valdkondet
dc.contributor.otherTartu Ülikool. Molekulaar- ja rakubioloogia instituutet
dc.date.accessioned2025-08-01T11:53:38Z
dc.date.available2025-08-01T11:53:38Z
dc.date.issued2025
dc.description.abstractPeamine saagikust ja saagi kvaliteeti mõjutavad tegurid on taimehaigused. Märkmismväärseid saagikadusid ja mugulate kvaliteedi langust põhjustab kartuli Y-viirus (PVY) mistõttu on selle ennetamine ja varajane tuvastamine äärmiselt oluline. Magistritöö eesmärk oli iseloomustada Eestis esinevaid PVY tüvesid, hinnata nende geneetilist mitmekesisust ja viia läbi fülogeneetiline analüüs ning tuvastada kaasnevaid RNA-viirusi RNA-sekveneerimise ja bioinformaatika abil. Tuvastati rekombinantsed tüved PVYNTN(a) ja PVYN-Wi. Fülogeneetiline analüüs näitas, et Eesti PVY isolaadid kuuluvad kahte erinevasse klastritesse koos teiste Euroopa, Lähis-Ida ja Aasia päritolu järjestustega. Lisaks PVY’le tuvastati mitmeid teisi viiruse järjestusi, kuid nende esinemine vajab täiendavat tõlgendust.
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/10062/112278
dc.language.isoet
dc.publisherTartu Ülikoolet
dc.rightsAttribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 Estoniaen
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/ee/
dc.subjectkartuli Y-viirus
dc.subjectgenoomijärjestus
dc.subjectrekombinantsed tüved
dc.subjectfülogeneetiline puu,
dc.subjecttaksonoomiline klassifitseerimine
dc.subject.othermagistritöödet
dc.titleKõrge läbilaskevõimega sekveneerimise rakendamine viiruste tuvastamiseks Eesti seemnekartulis ja kartuli Y-viiruse tüvede identifitseerimine bioinformaatiliste meetoditega
dc.typeThesisen

Failid

Originaal pakett

Nüüd näidatakse 1 - 1 1
Pisipilt
Nimi:
Anette Stražev.pdf
Suurus:
1.92 MB
Formaat:
Adobe Portable Document Format
Lae alla

Kollektsioonid

MRI magistritööd – Master's theses