Saccharomyces cerevisiae mudelsüsteemi loomine uurimaks Yaf9 valgu YEATS-domeeni funktsioone

Abstract

Histooni „sabade“ post-translatsionilise modifitseerimise abil saab kontrollida kromatiini avatust mingis kindlas regioonis ning selle kaudu reguleerida transkriptsiooni. Modifitseerimiseks seonduvad histooni „sabadega“ spetsialiseerunud valgud, millel on domeenid, mis „sabade“ aminohappejääkide põhist modifitseerimismustrit ära tunnevad. Üheks selliseks domeeniks on YEATS-domeen, mida leidub Saccharomyces cerevisiae kolmel valgul: Yaf9, Taf14 ja Sas5. On teada, et Yaf9 YEATS-domeen on seotud transkriptsiooni reguleerimisega, kuid selle täpne funktsioon ja töömehhanismide uurimine on olnud raskendatud, kuna YEATS-domeeni eemaldamisel muutub Yaf9 valk ebastabiilseks ja seda ei ekspresseerita enam normaalsel tasemel. Käesoleva töö eesmärgiks oli konstrueerida S. cerevisiae tüved, kus Yaf9 valgu YEATS-domeen oleks vahetatud ära valgu Taf14 või valgu Sas5 YEATS-domeeniga ja tuvastada, kas pärm on võimeline sellist hübriidset valku ka ekspresseerima. Edasine uurimine, kuidas selline hübriidne valk rakusiseseid protsesse võib mõjutada, aitaks paremini mõista Yaf9 YEATS-domeeni funktsiooni.