Pseudomonas putida geenide pfeR-II ja gacS promootorite asukoht ja võimalik regulatsioon ekskludoniga

Abstract

P. putida on laialdase levikuga bakter, mis muuhulgas koloniseerib risosfääri ning millel on kirjeldatud taimekasvu soodustavat mõju. Biofilmi moodustumisel on taimejuurte koloniseerimises on oluline roll. GacS-GacA on kahekomponendiline süsteem, mille aktivatsioon soodustab biofilmi teket. PfeR-II valgu funktsioon ei ole teada, kuid võib olla seotud raua omastamisega. Antud töö käigus tuvastati P. putida geenide gacS ja pfeR-II promootorid ning uuriti antud promootorite sõltuvust alternatiivsest sigma faktorist RpoS ja globaalse regulaatorvalgu Fis mõju. Lisaks hinnati erinevate faktorite mõju geeni pfeR-II transkriptsioonile.