23S rRNA modifikatsioonide osa ribosoomide struktuuri stabiliseerimisel

Abstract

Ribosoomid teostavad valgusünteesi ning nende rRNA modifikatsioonid on olulised ribosoomi korrektseks talitluseks ja struktuuriks. Käesolev töö keskendub 23S rRNA modifikatsioonide rollile 50S alaühiku struktuurses stabiliseerimises. Eesmärgiks oli luua in vitro testsüsteem, et hinnata 23S rRNA V domeeni modifikatsioonide mõju peptidüültransferaassele aktiivsusele. Selleks analüüsiti metsiktüüpi ja modifikatsioonideta E. coli tüvedest (kus modifitseerivate ensüümide geenid olid inaktiveeritud) eraldatud 50S alaühikute stabiilsust ning aktiivsust. Tulemused näitasid, et 23S rRNA modifikatsioonid on kriitilised 50S alaühiku termostabiilsuse ja funktsionaalsuse säilitamiseks. Modifikatsioonide puudumine muutis ribosoomid temperatuuritundlikumaks, viidates nende panusele ribosoomi struktuuri kaitsmisel.