Mitokondriaalsed DNA metüültransferaasid kui potentsiaalsed mitokondriaalse nukleoidiga assotsieerunud valgud ja nende roll mtDNA säilitamises

Abstract

Mitokondrite talitlus on otseselt seotud mitokondriaalse DNA-ga (mtDNA), mis esineb kompleksis spetsiifiliste valkudega, moodustades kompaktseid struktuure – nn nukleoide. Mitokondriaalne DNA helikaas Twinkle ja transkriptsioonifaktor A (TFAM) kuuluvad nukleoidi “tuumikvalkude” hulka ning on olulised mtDNA säilitamises. MtDNA metabolism võib olla reguleeritud epigeneetiliste mehhanismide kaudu. Seni avaldatud andmed nii mtDNA metülatsiooni kui ka metülatsiooni eest vastutavate DNA metüültransferaaside (DNMT) kohta on endiselt vastuolulised. Käesoleva töö käigus on näidatud DNA metüültransferaaside – DNMT1 ja DNMT3A – esinemine HEK293e rakkude mitokondriaalses fraktsioonis. Töö käigus ilmnes, et DNMT1 ja DNMT3A hulk rakus muutub vähesel määral vastusena kahe mitokondriaalse nukleoidiga assotsieerunud valgu mahasurumisele. Siiski selgus, et HEK293e rakuliini mtDNA NCR piirkonna tsütosiini metülatsioon on, kui üldse, tühine ning suure tõenäosusega ei oma regulatoorset tähtsust mitokondriaalses geeniekspressioonis ja/või DNA säilitamises.