Poomisvastuse mõju Pseudomonas putida mõõdukate faagide infektsioonitsükli valikule

dc.contributor.advisorTamman, Hedvig, juhendaja
dc.contributor.advisorRosendahl, Sirli, juhendaja
dc.contributor.authorMägi, Elise
dc.contributor.otherTartu Ülikool. Loodus- ja täppisteaduste valdkondet
dc.contributor.otherTartu Ülikool. Molekulaar- ja rakubioloogia instituutet
dc.date.accessioned2025-08-01T11:25:57Z
dc.date.available2025-08-01T11:25:57Z
dc.date.issued2025
dc.description.abstractMõõdukad bakteriofaagid (faagid) võivad viljeleda nii lüsogeenset kui ka lüütilist elutsüklit ning on võimelised ühelt elutsüklilt teisele üle minema. Infektsioonitsükli valiku eelistust kujundavad mitmesugused nii bakterist kui ka keskkonnast lähtuvad mõjurid. Leidub viiteid, et üheks selliseks elutsükli mõjuteguriks võiks olla ka bakteri poomisvastus, mille vallandab stressitingimustes alarmoon ppGpp. On teada, et P. putida PaW85 genoom sisaldab nelja krüptilist profaagi, kuid seni pole isoleeritud ühtegi seda bakterit nakatavat mõõdukat faagi, mistõttu pole olnud võimalik ppGpp mõju neile uurida. Käesoleva töö eesmärk oli välja selgitada ppGpp ja ühtlasi ka poomisvastuse mõju P. putida profaagide lahkumissagedusele bakteri genoomist ning isoleerida keskkonnatüvedest nakatamisvõimelisi mõõdukaid faage. Tulemused näitavad, et poomisvastus soodustab lüsogeensust profaagidel P1 ja P4, kuid profaagide P2 ja P3 lahkumissagedusele ppGpp mõju ei avalda. Samuti õnnestus KAR37 tüvest isoleerida esimene P. putida PaW85 nakatav mõõdukas faag ViKa.
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/10062/112273
dc.language.isoet
dc.publisherTartu Ülikoolet
dc.rightsAttribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 Estoniaen
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/ee/
dc.subjectPseudomonas putida
dc.subjectprofaag
dc.subjectmõõdukas faag
dc.subjectppGpp
dc.subjectpoomisvastus
dc.subject.othermagistritöödet
dc.titlePoomisvastuse mõju Pseudomonas putida mõõdukate faagide infektsioonitsükli valikule
dc.typeThesisen

Failid

Originaal pakett

Nüüd näidatakse 1 - 1 1
Laen...
Pisipilt
Nimi:
Elise_Mägi.pdf
Suurus:
1.31 MB
Formaat:
Adobe Portable Document Format