Sic1 baasil loodud sünteetiliste degronite fosfosaitide iseloomustamine Saccharomyces cerevisiae’s

Abstract

Rakkude ehituskividena pakuvad valgud mitmeid viise ka rakutsükli mõjutamiseks. Valkude töötlemine võimaldab nende funktsiooni muuta, näiteks läbi fosforüleerimise. Sic1 valk vastutab rakus sünteesifaasi minemise ehk rakutsükli alustamise eest. Sic1 valku lagundatakse ubikvitiin-proteasoomi rajas, kuhu võib valk sattuda fosfodegronite fosforüleerimise kaudu tsükliinsõltuva kinaasiga. Käesolevas bakalaureusetöös disainiti Sic1 baasil sünteetilised degronid, mille erinevate fosforüleerimissaitide mõju Sic1 lagundamisele uuriti in vivo degronile liidetud eGFP ja mCherry fluorestsentsmarkerite abil mikroskoobi ning FACSiga. Samuti uuriti aminohappelise järjestuse mõju degronis kinaasiga seondumisel. Kogutud andmeid ning loodud katsesüsteemi saab edaspidi kasutada erinevate kontrollitava toimega fosfodegronite loomiseks.