Pseudomonas fluorescens PC20 rulAB operonide roll UV taluvusel ja UV kiirgusest tingitud mutageneesil

Abstract

rulAB geenid kodeerivad Escherichia coli vigaderohke DNA polümeraas V ortoloogi, mille osalust on näidatud UV kiirguse tekitatud DNA kahjustuste ülesünteesis. Varasema uuringu käigus isoleeriti fenoolsete ühenditega reostunud Kirde-Eesti veekogust keskkonnabakter Pseudomonas fluorescens tüvi PC20, mille DNA sekveneerimisandmetest leiti, et tal leidub lausa kolm koopiat rulAB geene. Käesolevas töös uuriti kas üks või mitu P. fluorescens PC20 tüve rulAB operoni võiksid omada teadaolevat vigaderohke DNA Pol V omadusi. PC20 rulAB geenide funktsionaalsuse testimiseks viidi läbi UV taluvuse ja UV mutageneesi eksperimendid, viies rulAB geenid plasmiidi koosseisus kontrolltüvesse Pseudomonas putida PaW85.,Paralleelselt tehti samu katseid P. fluorescens PC20 tüvest konstrueeritud deletsioontüvedega,mille genoomist on rulAB geenid ühekaupa või mitmekesi koos eemaldatud.