Mutantse YEATS-domeeniga Yaf9 valgu konstrueerimine TurboID mudelsüsteemis pagaripärmis Saccharomyces cerevisiae

Abstract

YEATS-domeen on histoonide post-translatsiooniliste modifikatsioonide (PTM) lugejavalk. PTM-id on peamine mehhanism kromatiini pakkimisastme ja seeläbi geenide transkriptsiooni reguleerimisel (Mariño-Ramírez et al., 2005; Wood & Shilatifard, 2004). Üheks keskseks modifikatsiooniks on atsetüleerimine, mis suurendab DNA kättesaadavust transkriptsiooniks (Ito & Adcock, 2002). Käesolev töö keskendub pagaripärmi Saccharomyces cerevisiae Yaf9 valgu YEATS-domeenile, mis tunneb ära atsetüleerimise (Zhang et al., 2004). Töö eesmärk oli konstrueerida S. cerevisiae tüvi TurboID mudelsüsteemis, kus Yaf9 YEATS-domeen sisaldab punktmutatsioone H39A ja F46A, ning hinnata, kas selline valk pärmis ekspresseerub. Edasine analüüs mutatsioonide mõjust rakkude talitlusele võimaldaks paremini mõista Yaf9 YEATS-domeeni seondumisspetsiifikat ja funktsiooni transkriptsiooni regulatsioonis.