BipA ja YjgA roll bakteriaalse ribosoomi biogeneesis: Escherichia coli deletsioontüvede konstrueerimine ja fenotüübiline analüüs

Abstract

Ribosoomi biogenees on keeruline protsess, mille efektiivsust rakus aitavad tagada biogeneesi abifaktorid. Valgud YjgA ja BipA on arvatavasti biogeneesi abifaktorid, kuid nende osalusest biogeneesis on veel vähe teada. Käesoleva bakalaureusetöö eesmärgiks oli konstrueerida E.coli mudelsüsteem, kus on deleteeritud yjgA ja/või bipA geen ning mudelsüsteemi abil uurida YjgA ja BipA puudumise mõju bakteriaalse ribosoomi biogeneesile. Selleks analüüsiti konstrueeritud tüvede kasvukõveraid ja sahharoosigradiendi profiile. Tulemustest selgus, et YjgA ja/või BipA puudumine rakust põhjustab madalamal temperatuuril toitainetevaeses keskonnas kasvudefekti. BipA puudumine rakust tekitab ribosoomide biogeneesi defekti, mis väljendub biogeneesi vahepartiklite kuhjumisena rakus.